O lançamento do jogo THE NEW GATE foi marcado por um evento sombrio quando milhares de jogadores começaram a morrer ao ficarem presos no mundo virtual do game. Shin foi o herói responsável por derrotar o último chefe e libertar todos os jogadores, mas acabou sendo engolido por uma luz estranha que, não só o manteve no mundo de THE NEW GATE, como também o enviou para uma versão do futuro. Agora sem saber como voltar para o mundo real, Shin precisará descobrir o que está acontecendo, enquanto tenta se adaptar as mudanças que aconteceram em 500 anos.